Hi-TOM(High-throughput Tracking of Mutations)是一种基于高通量测序和生物信息学分析的基因编辑突变检测技术。通过特异性引物扩增编辑靶位点,结合Illumina测序平台深度测序,利用自主开发的生物信息学算法,实现对基因编辑样本中编辑效率、突变类型、突变频率、脱靶效应的精准定量分析。
1. 周期:约7-14个工作日
2. 适用场景
应用场景 | 核心需求 |
CRISPR编辑效率评估 | 快速筛选高效sgRNA,评估Cas9/Cpf1等不同核酸酶编辑效果 |
基因编辑植株筛选 | 检测转基因植株突变类型,筛选纯合/杂合突变体 |
细胞系基因编辑质检 | 验证KO/KI细胞系编辑效果,确保单克隆纯合性 |
脱靶效应分析 | 预测并验证潜在脱靶位点,评估编辑安全性 |
基因编辑育种监测 | 检测编辑作物后代遗传稳定性,筛选无转基因痕迹编辑事件 |
3. 交付内容:
1、Hi-TOM高通量测序原始数据;
2、生信分析后的测序结果。
1. 超长读长覆盖:单次反应测序长度达10,000 bp,覆盖远距离多靶点,无需分步检测。
2.超高灵敏度:检测灵敏度达0.1%,可检出低频突变和嵌合体,优于Sanger测序100倍。
3. 精准定量:精确计算编辑效率、各类突变比例(插入/缺失/替换)、等位基因频率。
4. 高通量筛选:支持96孔板、384孔板批量检测,单次实验可完成数百个样本。
5. 全面突变信息:检出所有突变类型(SNV、Indel、大片段缺失),绘制完整突变谱。
样品类型 | 要求 | 邮寄条件 | 备注 |
基因组DNA | ≥20微克 | 干冰 | (1)OD260/280=1.8-1.9 (2)OD260/230=1.9-2.2 |
