植物整合位点分析是指通过分子生物学和基因组学技术,精确鉴定外源DNA片段(如T-DNA、转座子、CRISPR/Cas9元件、标记基因等)在植物基因组中的插入位置、拷贝数、插入方向及旁侧基因组序列。该技术是植物基因工程研究、转基因作物安全评价、基因编辑产品合规检测的核心环节。
1. 周期:约8-15个工作日
2. 适用场景
应用场景 | 核心需求 |
转基因作物安全评价 | 农业农村部转基因安全评价申报,需提供插入位点、拷贝数、旁侧序列 |
基因编辑产品合规检测 | 区分转基因与基因编辑,检测无外源DNA残留,验证编辑位点 |
T-DNA插入突变体库鉴定 | 大规模鉴定T-DNA插入位点,关联表型与基因功能 |
转座子标签系统分析 | 追踪转座子跳跃位点,构建突变体库 |
载体骨架残留检测 | 检测筛选标记基因、抗生素抗性基因、载体骨架序列残留 |
复杂编辑事件解析 | 检测大片段缺失、染色体易位、 unintended insertion |
3. 交付内容:
1、高通量测序原始数据;
2、完整分析报告。
1. 精准定位:精确鉴定外源片段插入染色体位置,精度达±50 bp。
2. 拷贝数定量:检测灵敏度达0.1%,准确定量插入拷贝数(单拷贝/多拷贝/串联重复),区分杂合/纯合状态。
3. 完整性评估:分析插入片段完整性(是否截断、重排、串联),验证载体骨架残留。
4. 高样本通量:支持96孔板、384孔板批量检测,单次实验可完成数百个样本。
5. 数据完整性:能够提供插入位点+拷贝数+旁侧序列+完整性+安全性评估。
样品类型 | 要求 | 邮寄条件 | 备注 |
基因组DNA | ≥20微克 | 干冰 | (1)OD260/280=1.8-1.9 (2)OD260/230=1.9-2.2 |